El 11 de enero de 1861, Benito Juárez hizo su entrada triunfal en la capital mexicana y organizó un nuevo gabinete. Con ello se materializó el fin de la Guerra de Reforma o los Tres Años.
Tras su entrada, Juárez convocó a nuevas elecciones, de las que resultó ganador sobre sus contrincantes, tomando posesión como presidente Constitucional de la República el 15 de junio de 1861.
Los militares que habían tomado parte contra los constitucionalistas fueron dados de baja permanentemente.